В школе-пансионе "Логос" учителя и ученики сталкиваются лицом к лицу с новыми опасностями. После взрыва в подземелье тайн и загадок становится еще больше. По школе стремительно распространяется смертельный вирус. Володя узнает, что в школе карантин, и военные оцепили территорию. Проникнуть в школу и покинуть пределы школьной территории теперь оказывается не так-то просто. Возвращению Даши рады не все ее друзья. Ребята вместе со всеми пытаются найти вакцину. Андрей тяжело переживает, что его семья осталась под завалом. Тем временем в школе появляются "новенькие"…. После зимних каникул в элитную загородную школу-пансион съезжаются ученики. Среди них старшеклассники Максим, Даша, Вика, Рома и Тема, а также двое новичков — Андрей и Надя Авдеевы, родители которых пропали при загадочных обстоятельствах. Даша сразу же обращает внимание на Андрея. Это раздражает Максима, который принимает новенького в штыки. Еще одна новая обитательница школы — уборщица Мария. Никто не знает о том, что она сбежала из психиатрической клиники и оказалась здесь совсем не случайно. В первый же учебный день из школы пропадает пожилой учитель истории Иван Савельевич.