Великая Отечественная война. На черноморском побережье командир корабля «Морской охотник» и его команда выслеживают вражескую подлодку, которая, по данным разведки, прячется в этих краях. Во время операции командир и сопровождающий его матрос не возвращаются вовремя из разведки. Операция находится под угрозой срыва, но на помощь морякам приходят две юные разведчицы Катя и Лида, которым удается отследить сигнал вражеской субмарины. Картина «Морской охотник» основана на повести Николая Чуковского.